国内首批PacBio Sequel Ⅱ实测数据发布~
2019.05.21


PacBio Sequel Ⅱ作为三代测序行业的新宠,正式入驻安诺优达短短12天,就已完成国内首批数据的测试。下面就让小编带大家一睹最新的Sequel Ⅱ下机数据吧~



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PacBio Sequel Ⅱ针对不同类型的研究,兼容HiFi和CLR两种测序模式。在本次测试中,优先选择了CLR测序模式中15 kb和20 kb DNA文库,分别试测1个SMRT®Cell,对下机数据进行质控统计。下面就和各位老师们分享不同插入片段文库的实测数据结果。


15kb DNA文库


使用微生物DNA构建15 kb DNA 文库进行1个SMRT®Cell测序,共计产出96.26 G,排除循环测序造成的增加数据,获得Unique Molecular 序列72.54 G,酶读长平均长度15 kb,N50为25.6 kb,Subreads 平均长度为11.2 kb,N50为17.6 kb。


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20kb DNA文库


使用植物DNA构建20 kb文库进行1个SMRT®Cell测序,共计产出102.84 G,获得Unique Molecular 序列83.17 G,酶读长平均长度15 kb,N50为25 kb,Subreads平均长度为12.4 kb,N50为19.2 kb。


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从目前展示的实测数据来看,安诺基因Sequel Ⅱ单个SMRT®Cell数据产出超过100 G,较官方发布的数据(平均80 G)相比在通量上具有很大的提升。后续安诺优达将继续对CLR测序模式下的30~40 kb DNA文库以及HiFi测序模式下的10 kb DNA文库和ISO-seq文库进行试测,并将在第一时间发布测试结果,敬请期待吧~


自2017年推出三代测序服务以来,安诺优达先后引进了10台PacBio Sequel和2台Sequel II测序仪产品服务类型涵盖三代基因组组装、人重测序、动植物重测序、全长转录组测序等;累计完成三代项目超800+,其中组装经验涉及中草药、林木、农作物、海洋生物、哺乳动物、昆虫和人等。日前,安诺优达宣布启动了ATCG(Annoroad Typical Chinese Genomes Database)数据库二期计划,旨在建立领先的“二代+三代”中国人群基因组数据库,助力挖掘中国人群特有的可靠变异,进一步推动三代测序在中国人群健康研究中的应用。


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